WordPress を 3.5 にアップグレードしたいです！でも更新ページへと行くと、「重要: アップグレードの前に データベースとファイルをバックアップしてください。」とメッセージがっ！無視するのも良くないですし。。。ということで本家の説明を見てきました。次のページです。
とても詳細に説明されています。ここで書かれているポイントは、WordPress サイトのファイル全部と、データベース全部のバックアップをとろうよ！ということですね。
これらのポイントを満たすよう黒い画面、つまり SSH でコマンドでささっと済ませてしまいましょう。そして次回も簡単にバックアップが取れるようシェルスクリプト、つまりちょっとしたアプリにしてしまいます。